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Dopo che gli originali [[Charmander]]two, [[Bulbasaur]]two e [[Squirtle]]two sono morti durante un esperimento, muore anche Ambertwo—la forma clone di Amber—, portando tutte le aspettative su Mewtwo. Il Dr. Fuji si fa prendere dal panico e fa assumere a Mewtwo un siero che sopprime le emozioni, cosa che potrebbe averlo portato ad avere una personalità difficile. Il tempo passa e Mewtwo matura, acquisendo lentamente coscienza di sé, e distrugge il laboratorio di [[New Island]], presumibilmente uccidendo tutti, incluso Fuji. Un ricordo delle sue ultime parole sopravvive all'esplosione e Mewtwo le custodisce, parole che [[Jessie]], [[James]] e {{MTR}} scoprono quando si introducono a New Island.
Il Dr. Fuji riapparirà in ''[[F22]]''.
==Pokémon==
Il Dr. Fuji è probabilmente basato sul personaggio dei giochi Mr. Fuji, che era conosciuto in precedenza come Dr. Fuji quando fondò il [[Laboratorio Pokémon]] sull'[[Isola Cannella]].
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==Nel manga==
Dr. Fuji compare nell'[[Mewtwo Strikes Back! (manga)|adattamento manga]] di ''Pokémon il Film - Mewtwo contro Mew''. Ha lo stesso ruolo della pellicola ed è lo scienziato che ha creato Mewtwo, anche se le sue motivazioni ed il legame con la sua creazione sono ampiamente differenti.
==Doppiatori==
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