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Il Sistema a chiave consente al giocatore di sbloccare alcune funzioni, ricevendo alcune chiavi che si ottengono durante il gioco. Alcune di queste chiavi sono esclusive di una versione, tuttavia potranno essere ottenute anche nell' altra versione, semplicemente inviandole.
====Elenco delle chiavi====
Di seguito, una lista di chiavi.
=====Difficoltà=====
*Modalità aiuto: diminuisce i livelli dei Pokémon avversari e anche il livello dell'IA in battaglia
**Si sblocca: sconfiggendo il [[Campione]]{{#invoke: sup|B2}}
*Modalità normale: I livelli dei Pokémon avversari e il livello dell'IA in battaglia è medio
**Si sblocca: dall'inizio
*Modalità ostacolo: aumenta i livelli dei Pokémon avversari e anche il livello dell'IA in battaglia
**Si sblocca: sconfiggendo il [[Campione]]{{#invoke: sup|N2}}
=====Aree=====
*[[Città Nera]]
**Si sblocca: dall'inizio, tuttavia per ottenere la chiave bisogna completare le prime cinque aree sul Grattacielo Nero{{#invoke: sup|N2}}
*[[Foresta Bianca]]
**Si sblocca: dall'inizio, tuttavia per ottenere la chiave bisogna completare le prime cinque aree sull'Albero Bianco{{#invoke: sup|B2}}
=====[[Rovine Sotterranee|Rovine]]=====
*Chiave Antro: Sblocca la sala di [[Regirock]] alle [[Rovine Sotterranee]]
**Si sblocca: Dall'inizio
*Chiave Iceberg: Sblocca la sala di [[Regice]] alle Rovine Sotterranee
**Si sblocca: Catturando Regirock{{#invoke: sup|B2}}
*Chiave Ferro: Sblocca la sala di [[Registeel]] alle Rovine Sotterranee
**Si sblocca: Catturando Regirock{{#invoke: sup|N2}}
===Asse Nintendo 3DS===
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